بخشی از حوزه‌های آخوندی در مواجهه با خشم و تنفر مردم، به تدریج دارند حساب خود را از رژیم جدا می‌کنند و علیه خامنه‌ای و تز ولایت فقیه که بسیاری از مراجع و روحانیان غیرحکومتی آن را ضداسلامی و بدعت می‌دانند موضع می‌گیرند. این وضعیت رو به رشد خامنه‌ای را وحشت‌زده کرده و آخوندهای حامی خود را به خط کرده که علیه این مخالفان ولایت فقیه موضع بگیرند و به دفاع از شخص او و تز خمینی ساخته «ولایت فقیه» بپردازند.
از جمله آخوندهای به صحنه فرستاده شده آخوند مدرسی عضو فقهای شورای نگهبان ارتجاع است که در روز 21اسفند96، دفاعش از خامنه‌ای اعتراف به انزوای وی و نفرت عمومی از ولی‌فقیه ارتجاع از آب در آمد. وی گفت:«برخی عمامه به سرها تبلیغ سکولاریسم می‌کنند/ روحیه سکولاریسم در دل عده‌یی از مردم نفوذ کرده است. چرا باید در این کشور برخی، روزنامه و سایت داشته باشند و تبلیغ سکولاریسم کنند؛ این افراد زیر هزار لایه به فعالیت می‌پردازند؛ متأسفانه برخی در بدیهیأت تشکیک می‌کنند؛ برخی متأسفانه عمامه هم به‌سر دارند و این مباحث را تکرار می‌کنند...»
آخوند احمد خاتمی در حوزة اصفهان ضمن نگرانی از موقعیت کلی نظام گفت: «دشمنان این انقلاب امروز عبور کردند از خط چپ و راست، در پی براندازی نظام اسلامی هستند... دشمن در پی ناامید کردن است، در پی این است که اینها حکومت را به دست گرفته‌اند، نمی‌توانند کشور را اداره کنند. می‌توانیم! به شرط این‌که مدیریت انقلابی حاکم باشد؛... من به متدینینی که گاهی از روی ناآگاهی، نه از روی غرض با انقلاب مخالفت می‌کنند و عملاً حرف ضد انقلاب آن ور آب را می‌زنند، نصیحت می‌کنم...»(تلویزیون رژیم – 9اسفند).
آخوند عبداللهی عضو خبرگان ارتجاع نیز در روز ۲۱اسفند به انزوای خامنه‌ای در حوزه‌ها اذعان کرد و گفت:«تفکر سکولاری آفت حوزه انقلابی است اگر نماینده‌ای انقلابی نباشد و غير انقلابیها وارد مجمع طلاب شوند، باید منتظر کسانی باشیم که دارای تفکر سکولار هستند و قصد دارند مسائل حوزه را از انقلاب و حکومت جدا کنند. اینها افرادی هستند که توجهی به سنتهای حوزه ندارند».
و بالاخره آخوند جنتی رئیس خبرگان ارتجاع در روز 24اسفند96 به امواجی که علیه «ولایت فقیه» و مخالفت با شخص خمینی و خامنه‌ای بپاخاسته اذعان کرد و گفت:«موج‌هایی آمده‌اند تا آثار امام را کم رنگ کنند و ما باید این موج ها را بشکنیم. هر چه داریم از ولایت فقیه است و باید این روحیه را زنده نگهداریم.
مجلس خبرگان دغدغه حفظ ارزشهای انقلاب، حفظ اخلاق اسلامی و روحیه جهادگری و ایثارگری را دارد.نسبت به رهبری و ولایت فقیه تأکید داریم چون ستون انقلاب اسلامی است... »(تلویزیون رژیم).
آخوند عبدالکریم فرحانی عضو دیگر خبرگان ارتجاع در روز ۲۳اسفند در جریان اجلاس خبرگان نظام به « جریانی » بیرون حوزه‌ها علیه «ولایت فقیه» اذعان کرده و از جمله گفت: «اتاق فکری وجود دارد که در پی ارتجاع فرهنگی و اقتصادی و در تقابل با اندیشه‌امام و مطالبات مقام معظم رهبری است و نتیجه آن بر زمین ماندن مطالبات ایشان و سهل‌انگاری در حل مشکلات مردم است. نتیجه آن تنها ماندن مقام معظم رهبری است. چرا باید کار به آن جا برسد که ایشان به‌خاطر عدم تحقق عدالت عذرخواهی کند».
آخوند مصباح یزدی از باند خامنه‌ای در روز ۲۲اسفند برای ترساندن مخالفان خامنه‌ای در حوزه‌ها به آنها تلویحا نفرت مردمی از نظام ولایت را یادآوری کرده و خاطرنشان نمود مخالفت با «ولایت فقیه» یعنی « تیشه به ریشه زدن».
این موج به‌طور خاص پس از قیام مردم ایران و شعار مرگ بر خامنه‌ای و مرگ بر اصل ولایت فقیه جدیتر شده است و بر علنی شدن انزوای رژیم در حوزه‌ها دامن زده است. کما این‌که مدتی قبل در قم، حسین شیرازی در جلسه درسش ولایت فقیه و ولی‌فقیه را به فرعون تشبیه کرد. باید گفت این از نتایج سحر قیام مردم ایران است باش تا صبح دولتش بدمد تا ریش و ریشهٴ اندیشه ارتجاعی خمینی را از دامن ایران‌زمین بزداید.
